博物館內依主題舉辦各種展覽。

【白堊紀世界與化石】
展廳內陳列約1,000件化石，主要是在北海道發現的菊石，展廳的顏色為藍色，讓人聯想到一億年前的白堊紀海洋。被譽為日本最好的菊石博物館，展示來自北海道的約190種、約600件菊石。

【當地人的足跡】
自明治時代以來，三笠市的煤礦十分繁榮，許多人住在那裡。在這些人當中，湧現了許多在各個領域留下了印記的人。這個展覽室展示了兩個醫學領域的人、一個藝術領域的人、一個體育領域的人的物品和紀念品。

【煤炭工業的開端】
三笠的現代歷史始於明治時期在該市發現煤炭。該展區介紹了煤炭的基本知識，例如煤炭是什麼、如何製造以及如何使用。

【煤礦與人民生活】
自 1879 年（明治 12 年）幌內煤礦開業，到 1989 年（平成 1 年）最後一個煤礦關閉為止，三笠市與煤礦的合作已超過 110 年。有一個年代展覽，直觀地總結了三笠煤炭工業的繁榮和衰落。

[總督察與囚犯]
鎮上有著隨著煤炭開採而發展起來的歷史，1882年（明治15年）設立的空知修事館也在這段歷史中扮演了重要的角色。修司館是相當於現代監獄的設施。主要展示修事館空知的資料，還有日本人到來之前的考古資料。

[森林資料展間]（別館）
三笠市約80%的面積是森林。展示室展示三笠生活的動物標本（毛絨動物、昆蟲）以及林業相關資料。

[露天博物館（自行車道）]
露天博物館是在1938年至1956年桂澤（現在的桂澤湖所在地區）用於運輸砍伐樹木的森林鐵路遺址上建造的，現已開發為自行車道（總長1.2）。植物和地質構造（只有行人和自行車可以進入）。起點位於博物館主樓東側，全長1.2公里，步行來回約40分鐘。

[圖書角等]
主樓一樓大廳一角設有圖書角，並設有專用桌椅（可容納6人）。圖書館角落旁邊有一個“兒童角落”，您可以在那裡玩手工製作的木製拼圖，其中的化石相關生物，如菊石、魷魚、章魚和三葉蟲。